I miljöbalken definieras en genetiskt modifierad organism som "en organism där det genetiska materialet har ändrats på ett sätt som inte inträffar naturligt genom parning eller naturlig rekombination". Enligt gentekniklagstiftningen anses vissa metoder ge upphov till genetisk modifiering medan andra metoder inte anses leda till genetisk modifiering under vissa förutsättningar.Följande metoder anses ge upphov till genetisk modifiering
1. Hybridnukleinsyratekniker som innebär bildande av nya kombinationer av genetiskt material genom att nukleinsyramolekyler, som framställts utanför en organism, införs i ett virus, en bakterieplasmid eller i något annat vektorsystem och överförs till en värdorganism, i vilken de inte förekommer naturligt, men med vilken de kan kontinuerligt förökas.
2. Metoder som innebär direkt införande i en organism av sådant ärftligt material som beretts utanför organismen, bl.a. mikroinjektion, makroinjektion och mikroinkapsling.
3. Cellfusion (inklusive protoplastfusion) eller hybridiseringsmetoder, som innebär att levande celler med nya kombinationer av ärftligt genetiskt material bildas genom fusion av två eller flera celler på ett sätt som inte förekommer naturligt.
Följande räknas inte som genetisk modifiering
Följande metoder anses inte leda till genetisk modifiering under förutsättning att hybrid-DNA-molekyler eller GMO inte används.
1. Befruktning in vitro.
2. Naturliga processer som konjugation, transduktion eller transformation.
3. Induktion av polyploidi.
Följande GMO undantas från vissa regler
GMO som framställts med nedanstående metoder omfattas inte av alla bestämmelser i förordningen (2000:271) och förordningen (2002:1086), under förutsättning att rekombinanta nukleinsyramolekyler (hybrid-DNA) eller annan GMO inte används:
1. Mutagenes.
2. Cellfusion av växtceller, om de resulterande organismerna även kan framställas med traditionella förädlingsmetoder.
Genetiskt modifierade människor omfattas inte av bestämmelserna i förordningen (2002:1086).
För innesluten användning gäller undantagen enligt 3 § i förordningen SFS 2000:271 dessutom:
1. mikroorganismer som framställs eller har framställts genom cellfusion (inklusive protoplastfusion) av prokaryota arter som utväxlar genetiskt material genom kända fysiologiska processer , om det är osannolikt att mikroorganismen är skadlig för människors hälsa eller miljön,
2. mikroorganismer som framställs eller har framställts genom cellfusion (inklusive protoplastfusion) av celler av eukaryota arter, inklusive framställning av hybridomceller och fusioner av växtceller,
3. mikroorganismer som framställs eller har framställts genom självkloning i celler av samma art eller i celler av fylogenetiskt nära besläktade arter, som kan utväxla genetiskt material genom naturliga fysiologiska processer, om det är osannolikt att mikroorganismen är skadlig för människors hälsa eller miljön.
Vissa GMM kan komma att undantas från regleringen efter beslut i särskild ordning, om de anses säkra i enlighet med direktiv 98/81/EG. När så sker, ska Arbetsmiljöverket upprätta förteckningar över dessa GMM enligt förordningen SFS 2000:271. Några sådana undantag har ännu inte beslutats i EU.